Glavne vrste: To uključuje bigvanide, alkohole, fenole, organske amine, piridine, izotiazolinone i druge.
Karakteristike: Pokazuju brzo baktericidno djelovanje; međutim, poseduju relativno lošu termičku stabilnost i izdržljivost i mogu izazvati određene štetne nuspojave. Oni se lako vezuju za anjonska mjesta na površini membrana bakterija i plijesni, ili reagiraju sa sulfhidrilnim grupama, na taj način ometajući sintezu proteina i sistem ćelijskih membrana, što učinkovito inhibira proliferaciju bakterija i plijesni. Ipak, skloni su raspadanju pod izlaganjem ultraljubičastom svjetlu, što rezultira kratkim vijekom trajanja; osim toga, neki organski antimikrobni agensi mogu imati toksične nuspojave.
Primjene: Trenutno, najšire istražena i korištena organska površinski{0}}aktivna antimikrobna sredstva su dušik-koja sadrže kationska jedinjenja-kao što su kvaternarne amonijum soli-koje se intenzivno primjenjuju u antimikrobnim premazima.
